有機涂層可以提高鎂合金的耐蝕性、耐磨性和美觀度，常被用作鎂合金表面涂層。有機涂層通常是由粘結劑、顏料和添加劑(如干燥劑、穩定劑、緩蝕劑等)組成，其主要成分是環氧樹脂、乙烯基樹脂、丙烯酸聚氨酯樹脂等各類樹脂。在涂覆有機涂層之前，適當的表面處理非常關鍵，因為鎂合金上的有機涂層附著力很差，在強腐蝕環境下容易脫落，所以必須去除鎂合金表面的污染物、粉塵、氧化物和缺陷結構里面的水和空氣。有機涂層可以通過噴漆、粉末噴涂、電泳涂層、溶膠- 凝膠涂層和等離子體聚合等多種方法制備。

        目前，在汽車用鎂合金部件防腐蝕表面處理中最常用的有機涂層是粉末噴涂和電泳涂層。粉末噴涂涂層作為最表面涂層比電泳涂層的防腐效果更好，因為粉末噴涂可以更好的防止電偶腐蝕且通用性更強。

        與其它類型的涂層一樣，鎂合金表面有機涂層技術也存在一些問題。如果沒有進行仔細地表面預處理，鎂合金表面很難形成均勻、無缺陷的有機涂層；要達到預期的防腐效果，必須在有機涂層外面再增加一層聚合物或者粉末涂層以形成多層結構。此外，涂覆過程需要使用有機溶劑也會造成一些環境問題。